Al monitoreo ambiental del Río Gualeguaychú que la subsecretaría de Ambiente y Seguridad Alimentaria realiza todos los meses se suma el trabajo elaborado por el equipo profesional del Laboratorio de Indicadores Biológicos y Gestión Ambiental (IBGA) de UADER, que contempla la extracción de muestras de fitoplancton (termino técnico para referirse al conjunto de organismo planctónicos que incluye algas microscópicas tales como diatomeas, dinoflagelados y alga azul-verde) y su análisis en laboratorio para determinar el tipo y cantidad de organismos que se hayan en el río como así también su comportamiento bajo distintas condiciones naturales. 

A través de un convenio de colaboración con la institución se propuso realizar cuatro monitoreos anuales, correspondiente a las estaciones, que se acoplan a los que ya se vienen realizando con frecuencia mensual. Los puntos de extracción son 10 y también se le realizan determinaciones físico-químicas, de residuos de metales pesados y microbiológicas en el Laboratorio de Investigaciones Ambientales municipal.

El fitoplancton juega un papel fundamental como base de las redes tróficas y como indicadores de calidad del agua por eso es de gran importancia su estudio para conocer su comportamiento en nuestro río.